يُعتبر فرع لبنان من أبرز وأكبر فروع الاتحاد، حيث كان له دور محوري في مسيرة النضال الوطني الفلسطيني، خاصة خلال مرحلة العمل الفدائي في لبنان. وقدّم الفرع عددًا كبيرًا من الشهداء، وأسهم كذلك في تأسيس الكتيبة الطلابية.

يتألف الفرع من خمس وحدات طلابية موزعة على مختلف المناطق اللبنانية، ويضم نحو 8000 طالب جامعي، يتوزعون على الجامعات اللبنانية والمعاهد الفنية العليا.